自然细菌群落通常表现出极高的物种多样性,其在分解和养分循环中发挥着关键作用。
SPIRE与gcMeta作为两大行星尺度微生物组资源,通过整合海量宏基因组数据,为系统性探索微生物多样性、功能及生态适应性提供了前所未有的平台。
2021年Ellabaan等人提出了一种计算方法来预测已知ARG的新细菌宿主,但其研究结果因基因组数据污染而受到严重质疑,高达88%的确认样本存在污染问题。
介绍了代谢基因簇聚类工具BiG-SCAPE和BiG-SLiCE的2.0版本更新,通过算法优化、功能扩展和性能提升,显著增强了大规模基因组数据中次级代谢产物多样性分析的准确性、可扩展性和用户体验。
整合宏基因组学、宏转录组学和代谢组学数据,揭示了高海拔流域融雪期土壤微生物爆发及其消亡过程中的氮循环动态。