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BiG-SCAPE是一种计算生物合成基因簇(BGCs)之间距离的工具,用于自动重建基因簇家族,即编码高度相似或相同分子的基因簇组。
antiSMASH是一个用于识别和分析微生物中生物合成基因簇(BGCs)的工具。本文介绍了antiSMASH的使用方法和分析流程。
生物合成基因簇(biosynthetic gene cluster,BGC) 是一类非常重要的基因集合类型,随着高通量测序技术和生物大数据处理工具的快速发展,直接从宏基因组(metagenome)中探索BGC的策略已经越来越成熟。
我们实验室开发了一种新型的用于个体生物和化学暴露组纵向测绘的可穿戴被动采样器:AirPie。