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Slurm集群使用基础

我们在做生物信息分析时,对于大规模的上游数据的处理,一般需要在大型服务器或集群上进行。我最早接触并使用的是一个基于SLURM调度系统的集群,在此记录一下基础使用方法。

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微生物群落构建(community assembly)

了解控制群落多样性、功能、演替和生物地理学的机制是生态学,尤其是微生物生态学中的一个核心,这里介绍了几种群落构建分析方法。

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GTDB基因组分类数据库及GTDB-Tk工具

GTDB(Genome Taxonomy Database)是一个基因组分类学数据库,旨在提供高质量的细菌和古细菌等分类信息。GTDB-Tk 是一个软件工具包,用于根据GTDB对细菌和古细菌基因组进行客观分类。