我将常用的各种函数整成了一个包:pcutils,包含各种绘图方法,这里介绍一下柱形图绘制及其各种变换,如饼图,环形图,河流图等。
有幸参加了2023肠道大会"CHINAGUT2023系列活动",这是我博士期间参加的第一个学术会议,怀着开阔眼界,见识科学前沿,学习新方法新技术的心态,听完了三天的报告,认识了一些大佬,收获颇丰。
抗生素抗性基因(ARGs)是指存在于细菌或其他微生物基因组中的基因,使它们具有对抗生素的抵抗能力。ARG被视为是一种新出现的生物污染物,是宏基因组研究的重要方面,这里介绍常用的rgi软件进行分析。
Reporter score是一种改良的微生物富集分析的新方法,这里分享其原理和一个实现的R包。
上次已经介绍过了使用R绘制系统发育树的基本用法,这次来复现文章里好看的树!