病毒在生态系统中扮演着关键角色,宏基因组中病毒序列的鉴定十分重要。本文介绍从宏基因组数据中鉴定病毒序列的主要方法和工具。
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MetaWRAP是一个集成的宏基因组分析工具包,侧重于宏基因组Binning,本文将介绍MetaWRAP的具体使用方法。
宏基因组分箱(Metagenomics Binning)是一个将宏基因组测序获得的DNA序列分类为离散组或“bins”的过程,在这里我们先从MetaBAT讲起,通过MetaBAT2实战来了解分箱流程。
宏基因组(Metagenome)是指对一个生态系统中的所有微生物进行DNA分析的过程,可以帮助研究人员了解微生物的多样性、功能和互作关系。这里介绍常用的上游分析流程。