MetaNet是一个用于组学网络分析的R包,提供了多种功能,包括网络构建、可视化、比较和稳定性分析等。最近我把MetaNet的预印本放到了bioRxiv上,欢迎大家阅读和使用。
中介分析是一种统计方法,用于研究自变量(X)通过一个或多个中介变量(M)影响因变量(Y)的机制。本文介绍了中介分析的基本概念和R语言中的实现方法,并探讨了结构方程模型(SEM)的应用。
使用MetaNet包获取KEGG通路网络,并进行注释和可视化。
使用pcutils包中的sample_map函数快速绘制采样地图,支持静态基础地图、自定义地理边界和交互式地图三种模式。
批量下载NCBI genome相关数据的R函数和现有工具介绍