2021年Ellabaan等人提出了一种计算方法来预测已知ARG的新细菌宿主,但其研究结果因基因组数据污染而受到严重质疑,高达88%的确认样本存在污染问题。
介绍了代谢基因簇聚类工具BiG-SCAPE和BiG-SLiCE的2.0版本更新,通过算法优化、功能扩展和性能提升,显著增强了大规模基因组数据中次级代谢产物多样性分析的准确性、可扩展性和用户体验。
整合宏基因组学、宏转录组学和代谢组学数据,揭示了高海拔流域融雪期土壤微生物爆发及其消亡过程中的氮循环动态。
metaTraits是一个整合了培养来源性状数据与基因组预测结果的微生物表型性状数据库,覆盖超过220万微生物基因组及140余种标准化性状,提升了微生物性状数据的可及性与互操作性。
本研究通过优化的病毒颗粒富集与生物信息学流程,在瑞典斯托达伦沼泽的多年冻土融化梯度上系统揭示了单链和双链DNA病毒的多样性分布、宿主互作网络及其对碳循环关键过程的潜在调控作用。