Qiime2物种注释可真慢呀😂,赶紧找了Kraken的替代方法,Kraken用于16S是现成的。但是ITS的Unite数据库问题自己折腾了一下解决了。
通过将从当前可用的基因组和 MAG 中识别的大规模全球 BGC 集合作为数据源,BiG-FAM 提供了可探索的微生物次生代谢多样性“图集”,以浏览和搜索跨类群的生物合成多样性。
iPhylo 是一个免费的用于生成,注释和可视化分类树的在线网站,可以绘制物种,化合物和其他层级结构的各种树图并方便地添加复杂注释信息。
扩增子(Amplicon)分析是研究微生物群落组成与功能的核心方法之一,这里学习并搭建一下自己用的比较舒服的流程。